아마 \begin{figure*} ~ \end{figure*}를 사용해서 그럴겁니다. asterisk(*) 붙은 figure나 table 환경은 투 컬럼이더라도 전체 판면에 걸치도록 해주는 것으로 알고 있습니다. 

대략 다음과 같이 해보시지요. 

%% bare_jrnl.tex

\documentclass[journal]{IEEEtran}

% *** GRAPHICS RELATED PACKAGES ***

\ifCLASSINFOpdf

\usepackage[pdftex]{graphicx}

\else

\usepackage[dvips]{graphicx}

\usepackage[caption=false,font=footnotesize]{subfig}

\fi

\usepackage[caption=false,font=footnotesize]{subfig}

\usepackage{lipsum}

\begin{document}

\lipsum[1-2]

\begin{figure}[!t]

\centering{%

\subfloat[first graphic]{\includegraphics[width=2.5in]{test}%

\label{fig_first_case}}

\subfloat[second graphic]{\includegraphics[width=2.5in]{test}%

\label{fig_second_case}}}

\caption{Simulation results}

\label{fig_sim}

\end{figure}

\lipsum[3-7]

\end{document}