TeX Live 2014 사용, xelatex으로 컴파일 했습니다. (제가 오늘은 잘 잊어버리는 날인가보네요. 이것 저것.. ^^ )
1. 자동 들여쓰기 : 사실, hwp에서 변환(?) 작업을 하는 중이라서 작업이 된 것도 있지만 아직 소스가 많이 남았습니다. 눈으로 보면서 줄바꿈을 확인하여 `\\`를 일일히 삽입하려니 한숨이 나와서 질문 올렸습니다. nanim님이 말씀해주신 설정을 찾고 있었는데 mdframed 메뉴얼에선 못찾겠더군요. 잘 해결되었습니다.
2. 저는 함초롬 폰트 페밀리에 nomal, bold가 있어서 한글단에서 한번 설정하면 한자단도 자동으로 따라갈 줄 알았습니다.