이런 일은 겪어본 적이 없는데... 

일단 texdoc luaotfload 해서 "font names database"란 이름의 절을 한 번 읽어보시구요.

그리고 명령행에서 mkluatexfontdb -f -v 를 실행해서 어느 폰트를 처리하다가 에러가 발생하는 지 확인합니다.

그 파일이름을 otfl-blacklist.cnf 란 파일에 적어넣고 이 파일을 $HOME/texmf/tex/luatex 에 둡니다.

이제 다시 mkluatexfontdb -f -v 를 실행해보세요.

그래도 문제가 계속되면 lualatex 팀에 버그 리포트해야겠죠.