개인별로 선호도 다르고 TeX이든 통상적인 워드프로세스 프로그램이든 사용하는 이유가 있겠지요마는, 제 경우 TeX을 쓰는 가장 큰 이유는 복잡한 수식 입력의 용이성입니다. 수학 분야 또는 수학적 표기를 다량으로 사용하는 분야의 논문을 쓰는 경우 아래아 한글이나 MS Word에 대비해 TeX이 가지고 있는 편리함은 비교불가능할 정도입니다. 그에 더해 논문이 독자가 읽는 형태로 완성된 뒤 수식의 미려함 또한 아래아 한글이나 MS Word가 따라올 수 없지요. TeX을 이용하면서 이런 편리함과 미려함을 느끼지 못한 분들은 굳이 TeX을 쓸 필요가 없는 분야에서 일을 하고 계시는 분들일 겁니다. 그런 분들은, by definition, 굳이 TeX을 쓸 이유가 없겠지요.

추가: 다른 분야는 모르겠고, 제 분야에서는 저널에 출판되기 전에 working paper형태로 논문이 돌아다니는 경우가 많고 working paper로 cite되기도 합니다. 이 경우 논문을 쓰는 행위 자체가 '출판'이 되고는 합니다. 그래서, LaTeX이 '출판'을 위한 프로그램이라는 말이 맞는다고 하더라도, 논문을 쓰는 행위 = 출판행위이므로 굳이 구분해서 볼 필요가 없기도 합니다.