\includepdf[pages=1-3]{myfile.pdf}가 myfile.pdf라는 외부 파일을 읽어들이는 것이라 보면,
먼저, myfile.pdf를 만들고, 따로 tex 파일을 만들어 \includepdf로 원하는 부분을 불러 들이면 되지 싶은데요.

기존 pdf파일의 부분만 따로 떼내는 것만 목적이라면, pdftk 같은 것으로도 되지 않을까 합니다.