latex+dvips를 쓰는 경우에만 (거의 20년 전에 주로 사용되었던) eps가 그대로 삽입됩니다. 지금은 어떤 텍 엔진을 사용하든 eps 파일은 자동으로 pdf로 변환되어 삽입됩니다. 말씀하신 그 특정 저널이 어떤 텍 엔진을 사용하는지 모르겠으나, eps  파일을 요구하니 eps 파일을 제공하면 그만입니다. 이참에 정말 eps만 받는지, pdf는 절대로 못 받겠다는지 문의해 보시는 것도 나쁘지 않을 듯합니다.