이 해결책에서는 

\makeindex[name=korean,title=국문색인,intoc=true]

명령이 없는데, 이 명령을 추가하자 에러가 생기는군요. 

그냥 참고문헌은 쓰던 대로 쓰고 본문에 일본어 문헌에 대한 설명을 추가하는 게 나을 것 같습니다.