감사합니다. fontspec에 오픈타입 피처를 켜는 기능만 있는 줄 알았더니 끄는 기능도 있었군요. 

맥 말고 윈도에서도 잘 됩니다. luatexko-normalize.lua를 교체하라는 지시를 깜빡한 채 테스트했더니 계속 엉뚱한 결과가 나와서 갸우뚱 거리던 차였습니다. 

\documentclass{article}

\usepackage{kotex}

\setmainfont[Script=Hangul,Language=Korean]{HCR Dotum LVT}

\usepackage{colorjamo}

\luatexhangulnormalize=2

\begin{document}

\jamocolorcho {992211} % color of leading consonants. default is red.

\jamocolorjung{2244FF} % color of medial vowels. default is green.

\jamocolorjong{444422} % color of final consonants. default is blue.

\jamotransparency {FF} % FF: full opaque, 00: full transparent

\begin{colorjamo}

ᄒᆞᆫ글 

한국텍학회 The Korean \TeX\ Society

함초롬돋움

\end{colorjamo}

\setmainfont[Script=Hangul,Language=Korean,RawFeature=-ccmp]{Source Han Sans K}

\begin{colorjamo}

ᄒᆞᆫ글

한국텍학회

본고딕 Korean by 어도비=노토 산스 by 구글

\end{colorjamo}

\setmainfont[Script=Hangul,Language=Korean,RawFeature=+ccmp]{Source Han Sans K}

\begin{colorjamo}

ᄒᆞᆫ글

한국텍학회

본고딕 Korean by 어도비=노토 산스 by 구글

\end{colorjamo}

\end{document}