메타님 답변 보고 응용해서 해결했습니다.

%목차에 나타내지 않기/나타내기
\newcounter{oldtocdepth}
\newcommand{\hidefromtoc}{%
  \setcounter{oldtocdepth}{\value{tocdepth}}%
  \addtocontents{toc}{\protect\setcounter{tocdepth}{-10}}%
}

\newcommand{\unhidefromtoc}{%
  \addtocontents{toc}{\protect\setcounter{tocdepth}{\value{oldtocdepth}}}%
}
%목차에 나타내지 않기/나타내기 끝

\appendix
\addcontentsline{toc}{chapter}{Appendix A code code} %TOC에 보여지는 부분: 수작업으로 바꿔주면 될거 같아요.
\hidefromtoc
\chapter{code code} %이렇게 하면 본문에는 자연습럽게 appendix가 나오네요.
\unhidefromtoc
bla bal bla

힌트 감사합니다.(논문 다 쓰고 신경쓰려고 했는데 좋은 힌트 주셨네요.)