한글 완성형의 물결표시는 유니코드로 U+223C가 맞습니다.

그런데 xetexko 매뉴얼을 보면

1.  setmainhangulfont를 설정하고 한자 폰트를 따로 지정하지 않았을 때 한자는 한글 폰트를 따라갑니다.

2.  게다가 \xetexkofontregime[alphs=latin]{hangul} 이라 지시했으므로 CJK 기호는 한글 폰트로 찍힙니다.

이 두가지가 모두 작동하지 않았다니 이해가 되지 않네요.

<추가>

음... 아마도 oblivoir나 memhangul을 부르셨나 봅니다. 이게 다소 오래된 코드라서 xetexko 요즘 버전과 잘 맞지 않는 부분이 있습니다.