글쓴이 입니다.

다시 보다보니 cls 파일의 contents, chapter 정의 하는 곳에 'sffamily'라는 옵션을 찾았습니다. 

San serif 폰트로 바꿔버리는 명령어더라구요. 이 부분을 'rmfamily' 로 변경하니 원하는대로 수정되었습니다.

설명이 너무 허접하지만, 혹시 저와는 반대로 글꼴을 바꾸고자 하시는 분은 참고하셔도 될 것 같습니다.