예 말씀하신 것 처럼, TeXLive 2011을 uninstall하고 리부팅후 TeXLive 2012를 설치하는 것이 좋을 듯 합니다.

뭐 설치용 .bat화일이 잘되어 있어서, 그것을 매뉴얼 삼아, 설치하니 잘 되었었습니다. ^^;