정보 감사합니다. 일단 os 문제는 아닐겁니다.

클라우드 식으로 레포를 올리면 github 알아서 돌려주는식이기 때문입니다.

저도 정확한 원인은 모르겠지만 정말로 특정 theme가 안되는 경우일 수도있고 

가져온 _config.yml의 세팅과 미세하게 차이가 있어서 적용이 안되는 것 일수도있다고 생각합니다.

개인적으론 후자쪽이 맞지 않을까 싶습니다.