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hmltotex
제가 조금 더 알아보니 gpl 라이선스가 적용된 프로그램을 command line으로 호출하여 사용하는 경우에는 프로그램 설치 정보만 안내하면 라이선스 위반 문제가 없는 것 같습니다.
제 프로그램은 중간중간 "pdflatex.exe a.tex"과 같은 command line 명령을 수행하기만 하고, pdflatex의 소스코드 혹은 바이너리가 제 프로그램에 포함되어 있지는 않습니다.
command line을 이용하여 pdflatex을 호출하기 때문에 문제가 없는 것 같습니다. (GPL의 파생 저작물로 보지 않는 경우에 해당)
다만 제 프로그램을 설치 시 gpl 프로그램(pdflatex)이 같이 설치된다는 정보만 안내하면 되는 것 같습니다.
말씀해주신 MikTeX 환경 또한 고려해 보도록 하겠습니다.
시간 내어 답변 해 주셔서 감사합니다!